Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC85AQ96PX6 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC85AQ96PX6 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms