Protein–RNA interactions for Protein: Q96PL1

SCGB3A2, Secretoglobin family 3A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB3A2Q96PL1 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCGB3A2Q96PL1 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms