Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC17Q96LX7 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC17Q96LX7 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms