Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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UBE2E2Q96LR5 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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UBE2E2Q96LR5 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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UBE2E2Q96LR5 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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UBE2E2Q96LR5 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
UBE2E2Q96LR5 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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