Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM47Q96LD4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms