Protein–RNA interactions for Protein: Q96L94

SNX22, Sorting nexin-22, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX22Q96L94 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX22Q96L94 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms