Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PKNOX2Q96KN3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PKNOX2Q96KN3 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms