Protein–RNA interactions for Protein: Q96JL9

ZNF333, Zinc finger protein 333, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF333Q96JL9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF333Q96JL9 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms