Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BORCS6Q96GS4 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BORCS6Q96GS4 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BORCS6Q96GS4 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BORCS6Q96GS4 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BORCS6Q96GS4 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
BORCS6Q96GS4 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BORCS6Q96GS4 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BORCS6Q96GS4 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BORCS6Q96GS4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BORCS6Q96GS4 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BORCS6Q96GS4 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BORCS6Q96GS4 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BORCS6Q96GS4 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BORCS6Q96GS4 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BORCS6Q96GS4 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BORCS6Q96GS4 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BORCS6Q96GS4 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BORCS6Q96GS4 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BORCS6Q96GS4 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BORCS6Q96GS4 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BORCS6Q96GS4 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BORCS6Q96GS4 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BORCS6Q96GS4 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BORCS6Q96GS4 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BORCS6Q96GS4 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
BORCS6Q96GS4 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BORCS6Q96GS4 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BORCS6Q96GS4 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BORCS6Q96GS4 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BORCS6Q96GS4 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BORCS6Q96GS4 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BORCS6Q96GS4 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BORCS6Q96GS4 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BORCS6Q96GS4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BORCS6Q96GS4 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BORCS6Q96GS4 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BORCS6Q96GS4 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BORCS6Q96GS4 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BORCS6Q96GS4 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BORCS6Q96GS4 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BORCS6Q96GS4 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BORCS6Q96GS4 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BORCS6Q96GS4 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BORCS6Q96GS4 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
BORCS6Q96GS4 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BORCS6Q96GS4 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BORCS6Q96GS4 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BORCS6Q96GS4 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BORCS6Q96GS4 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BORCS6Q96GS4 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BORCS6Q96GS4 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BORCS6Q96GS4 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BORCS6Q96GS4 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BORCS6Q96GS4 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BORCS6Q96GS4 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BORCS6Q96GS4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BORCS6Q96GS4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BORCS6Q96GS4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BORCS6Q96GS4 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BORCS6Q96GS4 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
BORCS6Q96GS4 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BORCS6Q96GS4 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BORCS6Q96GS4 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BORCS6Q96GS4 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BORCS6Q96GS4 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BORCS6Q96GS4 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BORCS6Q96GS4 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
BORCS6Q96GS4 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BORCS6Q96GS4 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BORCS6Q96GS4 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BORCS6Q96GS4 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BORCS6Q96GS4 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
BORCS6Q96GS4 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BORCS6Q96GS4 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
BORCS6Q96GS4 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BORCS6Q96GS4 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BORCS6Q96GS4 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BORCS6Q96GS4 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BORCS6Q96GS4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BORCS6Q96GS4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BORCS6Q96GS4 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BORCS6Q96GS4 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BORCS6Q96GS4 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BORCS6Q96GS4 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BORCS6Q96GS4 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BORCS6Q96GS4 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BORCS6Q96GS4 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BORCS6Q96GS4 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BORCS6Q96GS4 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BORCS6Q96GS4 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BORCS6Q96GS4 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BORCS6Q96GS4 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BORCS6Q96GS4 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
BORCS6Q96GS4 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BORCS6Q96GS4 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
BORCS6Q96GS4 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BORCS6Q96GS4 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BORCS6Q96GS4 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BORCS6Q96GS4 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms