Protein–RNA interactions for Protein: Q96FC9

DDX11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, humanhuman

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX11Q96FC9 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DDX11Q96FC9 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX11Q96FC9 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX11Q96FC9 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX11Q96FC9 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX11Q96FC9 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX11Q96FC9 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX11Q96FC9 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX11Q96FC9 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX11Q96FC9 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX11Q96FC9 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX11Q96FC9 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX11Q96FC9 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX11Q96FC9 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX11Q96FC9 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX11Q96FC9 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX11Q96FC9 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX11Q96FC9 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX11Q96FC9 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX11Q96FC9 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX11Q96FC9 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX11Q96FC9 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX11Q96FC9 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX11Q96FC9 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX11Q96FC9 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX11Q96FC9 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX11Q96FC9 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX11Q96FC9 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX11Q96FC9 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX11Q96FC9 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX11Q96FC9 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX11Q96FC9 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX11Q96FC9 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX11Q96FC9 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX11Q96FC9 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX11Q96FC9 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX11Q96FC9 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX11Q96FC9 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX11Q96FC9 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX11Q96FC9 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX11Q96FC9 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX11Q96FC9 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDX11Q96FC9 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX11Q96FC9 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX11Q96FC9 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX11Q96FC9 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX11Q96FC9 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX11Q96FC9 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX11Q96FC9 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX11Q96FC9 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX11Q96FC9 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX11Q96FC9 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX11Q96FC9 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX11Q96FC9 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX11Q96FC9 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX11Q96FC9 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX11Q96FC9 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX11Q96FC9 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX11Q96FC9 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDX11Q96FC9 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms