Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SGF29Q96ES7 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGF29Q96ES7 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms