Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIRT1Q96EB6 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SIRT1Q96EB6 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms