Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NMD3Q96D46 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms