Protein–RNA interactions for Protein: Q96A61

TRIM52, Tripartite motif-containing protein 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM52Q96A61 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM52Q96A61 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms