Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF3C6Q969F1 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
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GTF3C6Q969F1 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
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GTF3C6Q969F1 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF3C6Q969F1 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
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