Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSR2Q969E8 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms