Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF3AQ92664 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms