Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUM0

NUP133, Nuclear pore complex protein Nup133, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP133Q8WUM0 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP133Q8WUM0 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP133Q8WUM0 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP133Q8WUM0 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP133Q8WUM0 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP133Q8WUM0 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP133Q8WUM0 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP133Q8WUM0 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP133Q8WUM0 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP133Q8WUM0 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP133Q8WUM0 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP133Q8WUM0 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP133Q8WUM0 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP133Q8WUM0 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP133Q8WUM0 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP133Q8WUM0 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP133Q8WUM0 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP133Q8WUM0 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP133Q8WUM0 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP133Q8WUM0 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP133Q8WUM0 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP133Q8WUM0 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP133Q8WUM0 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP133Q8WUM0 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP133Q8WUM0 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP133Q8WUM0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP133Q8WUM0 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP133Q8WUM0 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NUP133Q8WUM0 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP133Q8WUM0 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP133Q8WUM0 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP133Q8WUM0 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP133Q8WUM0 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP133Q8WUM0 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP133Q8WUM0 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP133Q8WUM0 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP133Q8WUM0 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP133Q8WUM0 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP133Q8WUM0 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP133Q8WUM0 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP133Q8WUM0 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP133Q8WUM0 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP133Q8WUM0 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP133Q8WUM0 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP133Q8WUM0 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP133Q8WUM0 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP133Q8WUM0 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP133Q8WUM0 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP133Q8WUM0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP133Q8WUM0 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP133Q8WUM0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP133Q8WUM0 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP133Q8WUM0 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP133Q8WUM0 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP133Q8WUM0 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP133Q8WUM0 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP133Q8WUM0 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP133Q8WUM0 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP133Q8WUM0 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP133Q8WUM0 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP133Q8WUM0 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP133Q8WUM0 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP133Q8WUM0 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP133Q8WUM0 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP133Q8WUM0 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP133Q8WUM0 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP133Q8WUM0 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP133Q8WUM0 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP133Q8WUM0 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP133Q8WUM0 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP133Q8WUM0 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP133Q8WUM0 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP133Q8WUM0 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP133Q8WUM0 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP133Q8WUM0 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP133Q8WUM0 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP133Q8WUM0 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP133Q8WUM0 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP133Q8WUM0 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP133Q8WUM0 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP133Q8WUM0 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP133Q8WUM0 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP133Q8WUM0 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP133Q8WUM0 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP133Q8WUM0 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP133Q8WUM0 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP133Q8WUM0 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP133Q8WUM0 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP133Q8WUM0 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP133Q8WUM0 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP133Q8WUM0 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP133Q8WUM0 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP133Q8WUM0 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP133Q8WUM0 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP133Q8WUM0 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP133Q8WUM0 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP133Q8WUM0 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP133Q8WUM0 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP133Q8WUM0 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NUP133Q8WUM0 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms