Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
SNX29Q8TEQ0 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SNX29Q8TEQ0 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms