Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ0

HAVCR2, Hepatitis A virus cellular receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAVCR2Q8TDQ0 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HAVCR2Q8TDQ0 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HAVCR2Q8TDQ0 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
HAVCR2Q8TDQ0 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
HAVCR2Q8TDQ0 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
HAVCR2Q8TDQ0 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HAVCR2Q8TDQ0 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HAVCR2Q8TDQ0 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HAVCR2Q8TDQ0 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HAVCR2Q8TDQ0 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HAVCR2Q8TDQ0 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HAVCR2Q8TDQ0 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HAVCR2Q8TDQ0 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HAVCR2Q8TDQ0 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HAVCR2Q8TDQ0 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HAVCR2Q8TDQ0 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HAVCR2Q8TDQ0 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HAVCR2Q8TDQ0 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HAVCR2Q8TDQ0 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HAVCR2Q8TDQ0 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HAVCR2Q8TDQ0 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HAVCR2Q8TDQ0 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HAVCR2Q8TDQ0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HAVCR2Q8TDQ0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HAVCR2Q8TDQ0 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HAVCR2Q8TDQ0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HAVCR2Q8TDQ0 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HAVCR2Q8TDQ0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HAVCR2Q8TDQ0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HAVCR2Q8TDQ0 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HAVCR2Q8TDQ0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HAVCR2Q8TDQ0 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HAVCR2Q8TDQ0 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HAVCR2Q8TDQ0 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HAVCR2Q8TDQ0 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HAVCR2Q8TDQ0 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HAVCR2Q8TDQ0 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HAVCR2Q8TDQ0 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HAVCR2Q8TDQ0 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HAVCR2Q8TDQ0 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HAVCR2Q8TDQ0 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HAVCR2Q8TDQ0 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HAVCR2Q8TDQ0 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HAVCR2Q8TDQ0 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HAVCR2Q8TDQ0 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HAVCR2Q8TDQ0 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HAVCR2Q8TDQ0 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HAVCR2Q8TDQ0 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HAVCR2Q8TDQ0 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HAVCR2Q8TDQ0 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HAVCR2Q8TDQ0 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HAVCR2Q8TDQ0 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HAVCR2Q8TDQ0 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HAVCR2Q8TDQ0 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HAVCR2Q8TDQ0 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HAVCR2Q8TDQ0 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HAVCR2Q8TDQ0 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HAVCR2Q8TDQ0 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HAVCR2Q8TDQ0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HAVCR2Q8TDQ0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HAVCR2Q8TDQ0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HAVCR2Q8TDQ0 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HAVCR2Q8TDQ0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms