Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTLL11Q8NHH1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTLL11Q8NHH1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms