Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CARMIL3Q8ND23 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CARMIL3Q8ND23 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms