Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00301Q8NCQ3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms