Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA66

CNBD1, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD1Q8NA66 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNBD1Q8NA66 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CNBD1Q8NA66 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms