Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
VPS8Q8N3P4 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
VPS8Q8N3P4 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
VPS8Q8N3P4 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
VPS8Q8N3P4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
VPS8Q8N3P4 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
VPS8Q8N3P4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
VPS8Q8N3P4 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
VPS8Q8N3P4 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
VPS8Q8N3P4 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
VPS8Q8N3P4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
VPS8Q8N3P4 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
VPS8Q8N3P4 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
VPS8Q8N3P4 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
VPS8Q8N3P4 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
VPS8Q8N3P4 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
VPS8Q8N3P4 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
VPS8Q8N3P4 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
VPS8Q8N3P4 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
VPS8Q8N3P4 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
VPS8Q8N3P4 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
VPS8Q8N3P4 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
VPS8Q8N3P4 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
VPS8Q8N3P4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
VPS8Q8N3P4 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
VPS8Q8N3P4 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
VPS8Q8N3P4 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
VPS8Q8N3P4 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
VPS8Q8N3P4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
VPS8Q8N3P4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
VPS8Q8N3P4 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
VPS8Q8N3P4 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.32
VPS8Q8N3P4 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
VPS8Q8N3P4 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
VPS8Q8N3P4 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
VPS8Q8N3P4 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
VPS8Q8N3P4 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
VPS8Q8N3P4 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
VPS8Q8N3P4 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
VPS8Q8N3P4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
VPS8Q8N3P4 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
VPS8Q8N3P4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
VPS8Q8N3P4 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
VPS8Q8N3P4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
VPS8Q8N3P4 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
VPS8Q8N3P4 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
VPS8Q8N3P4 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
VPS8Q8N3P4 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
VPS8Q8N3P4 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
VPS8Q8N3P4 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
VPS8Q8N3P4 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
VPS8Q8N3P4 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
VPS8Q8N3P4 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
VPS8Q8N3P4 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
VPS8Q8N3P4 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
VPS8Q8N3P4 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
VPS8Q8N3P4 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
VPS8Q8N3P4 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
VPS8Q8N3P4 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
VPS8Q8N3P4 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
VPS8Q8N3P4 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
VPS8Q8N3P4 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
VPS8Q8N3P4 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
VPS8Q8N3P4 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
VPS8Q8N3P4 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
VPS8Q8N3P4 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
VPS8Q8N3P4 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
VPS8Q8N3P4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
VPS8Q8N3P4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
VPS8Q8N3P4 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
VPS8Q8N3P4 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
VPS8Q8N3P4 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
VPS8Q8N3P4 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
VPS8Q8N3P4 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
VPS8Q8N3P4 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
VPS8Q8N3P4 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
VPS8Q8N3P4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
VPS8Q8N3P4 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
VPS8Q8N3P4 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
VPS8Q8N3P4 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
VPS8Q8N3P4 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
VPS8Q8N3P4 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
VPS8Q8N3P4 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
VPS8Q8N3P4 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
VPS8Q8N3P4 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
VPS8Q8N3P4 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
VPS8Q8N3P4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
VPS8Q8N3P4 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
VPS8Q8N3P4 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
VPS8Q8N3P4 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
VPS8Q8N3P4 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
VPS8Q8N3P4 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
VPS8Q8N3P4 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
VPS8Q8N3P4 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
VPS8Q8N3P4 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
VPS8Q8N3P4 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
VPS8Q8N3P4 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
VPS8Q8N3P4 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
VPS8Q8N3P4 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
VPS8Q8N3P4 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms