Protein–RNA interactions for Protein: Q8N283

ANKRD35, Ankyrin repeat domain-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD35Q8N283 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD35Q8N283 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD35Q8N283 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD35Q8N283 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD35Q8N283 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD35Q8N283 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD35Q8N283 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD35Q8N283 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD35Q8N283 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD35Q8N283 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD35Q8N283 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD35Q8N283 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD35Q8N283 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD35Q8N283 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD35Q8N283 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD35Q8N283 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD35Q8N283 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD35Q8N283 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD35Q8N283 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD35Q8N283 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD35Q8N283 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD35Q8N283 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD35Q8N283 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD35Q8N283 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD35Q8N283 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD35Q8N283 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD35Q8N283 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD35Q8N283 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ANKRD35Q8N283 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ANKRD35Q8N283 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ANKRD35Q8N283 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ANKRD35Q8N283 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD35Q8N283 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD35Q8N283 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD35Q8N283 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD35Q8N283 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD35Q8N283 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD35Q8N283 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD35Q8N283 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD35Q8N283 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD35Q8N283 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD35Q8N283 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD35Q8N283 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD35Q8N283 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD35Q8N283 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD35Q8N283 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD35Q8N283 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD35Q8N283 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD35Q8N283 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD35Q8N283 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD35Q8N283 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD35Q8N283 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ANKRD35Q8N283 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD35Q8N283 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD35Q8N283 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD35Q8N283 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD35Q8N283 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD35Q8N283 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD35Q8N283 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD35Q8N283 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD35Q8N283 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD35Q8N283 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD35Q8N283 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD35Q8N283 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD35Q8N283 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD35Q8N283 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD35Q8N283 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD35Q8N283 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD35Q8N283 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD35Q8N283 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ANKRD35Q8N283 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD35Q8N283 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD35Q8N283 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD35Q8N283 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD35Q8N283 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD35Q8N283 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD35Q8N283 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD35Q8N283 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD35Q8N283 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD35Q8N283 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD35Q8N283 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD35Q8N283 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD35Q8N283 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD35Q8N283 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD35Q8N283 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD35Q8N283 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD35Q8N283 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD35Q8N283 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD35Q8N283 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD35Q8N283 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD35Q8N283 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD35Q8N283 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD35Q8N283 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD35Q8N283 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD35Q8N283 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD35Q8N283 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD35Q8N283 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD35Q8N283 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD35Q8N283 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ANKRD35Q8N283 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms