Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0Z9

VSIG10, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG10Q8N0Z9 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VSIG10Q8N0Z9 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VSIG10Q8N0Z9 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VSIG10Q8N0Z9 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VSIG10Q8N0Z9 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VSIG10Q8N0Z9 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VSIG10Q8N0Z9 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VSIG10Q8N0Z9 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VSIG10Q8N0Z9 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VSIG10Q8N0Z9 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VSIG10Q8N0Z9 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VSIG10Q8N0Z9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VSIG10Q8N0Z9 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VSIG10Q8N0Z9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms