Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLF2Q8IX21 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms