Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU1

IGDCC3, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 3, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGDCC3Q8IVU1 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGDCC3Q8IVU1 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGDCC3Q8IVU1 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGDCC3Q8IVU1 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGDCC3Q8IVU1 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGDCC3Q8IVU1 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGDCC3Q8IVU1 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGDCC3Q8IVU1 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGDCC3Q8IVU1 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
IGDCC3Q8IVU1 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGDCC3Q8IVU1 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGDCC3Q8IVU1 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGDCC3Q8IVU1 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGDCC3Q8IVU1 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
IGDCC3Q8IVU1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGDCC3Q8IVU1 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGDCC3Q8IVU1 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGDCC3Q8IVU1 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGDCC3Q8IVU1 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGDCC3Q8IVU1 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGDCC3Q8IVU1 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGDCC3Q8IVU1 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGDCC3Q8IVU1 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGDCC3Q8IVU1 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGDCC3Q8IVU1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGDCC3Q8IVU1 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGDCC3Q8IVU1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGDCC3Q8IVU1 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGDCC3Q8IVU1 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGDCC3Q8IVU1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGDCC3Q8IVU1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGDCC3Q8IVU1 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGDCC3Q8IVU1 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGDCC3Q8IVU1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGDCC3Q8IVU1 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGDCC3Q8IVU1 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGDCC3Q8IVU1 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGDCC3Q8IVU1 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGDCC3Q8IVU1 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGDCC3Q8IVU1 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGDCC3Q8IVU1 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGDCC3Q8IVU1 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGDCC3Q8IVU1 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
IGDCC3Q8IVU1 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
IGDCC3Q8IVU1 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IGDCC3Q8IVU1 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IGDCC3Q8IVU1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IGDCC3Q8IVU1 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IGDCC3Q8IVU1 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IGDCC3Q8IVU1 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
IGDCC3Q8IVU1 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IGDCC3Q8IVU1 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IGDCC3Q8IVU1 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IGDCC3Q8IVU1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IGDCC3Q8IVU1 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IGDCC3Q8IVU1 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IGDCC3Q8IVU1 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IGDCC3Q8IVU1 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IGDCC3Q8IVU1 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IGDCC3Q8IVU1 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IGDCC3Q8IVU1 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IGDCC3Q8IVU1 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IGDCC3Q8IVU1 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IGDCC3Q8IVU1 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IGDCC3Q8IVU1 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IGDCC3Q8IVU1 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IGDCC3Q8IVU1 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IGDCC3Q8IVU1 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IGDCC3Q8IVU1 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IGDCC3Q8IVU1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IGDCC3Q8IVU1 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
IGDCC3Q8IVU1 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
IGDCC3Q8IVU1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IGDCC3Q8IVU1 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IGDCC3Q8IVU1 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IGDCC3Q8IVU1 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IGDCC3Q8IVU1 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IGDCC3Q8IVU1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IGDCC3Q8IVU1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IGDCC3Q8IVU1 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IGDCC3Q8IVU1 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
IGDCC3Q8IVU1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IGDCC3Q8IVU1 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IGDCC3Q8IVU1 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IGDCC3Q8IVU1 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IGDCC3Q8IVU1 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IGDCC3Q8IVU1 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IGDCC3Q8IVU1 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IGDCC3Q8IVU1 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IGDCC3Q8IVU1 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IGDCC3Q8IVU1 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IGDCC3Q8IVU1 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IGDCC3Q8IVU1 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IGDCC3Q8IVU1 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
IGDCC3Q8IVU1 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IGDCC3Q8IVU1 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
IGDCC3Q8IVU1 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IGDCC3Q8IVU1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
IGDCC3Q8IVU1 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IGDCC3Q8IVU1 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms