Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z739

YTHDF3, YTH domain-containing family protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3Q7Z739 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
YTHDF3Q7Z739 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms