Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT5

SSX7, Protein SSX7, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX7Q7RTT5 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SSX7Q7RTT5 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSX7Q7RTT5 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SSX7Q7RTT5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSX7Q7RTT5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SSX7Q7RTT5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SSX7Q7RTT5 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSX7Q7RTT5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SSX7Q7RTT5 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SSX7Q7RTT5 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SSX7Q7RTT5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SSX7Q7RTT5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SSX7Q7RTT5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SSX7Q7RTT5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSX7Q7RTT5 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SSX7Q7RTT5 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSX7Q7RTT5 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SSX7Q7RTT5 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSX7Q7RTT5 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SSX7Q7RTT5 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSX7Q7RTT5 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSX7Q7RTT5 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SSX7Q7RTT5 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SSX7Q7RTT5 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SSX7Q7RTT5 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSX7Q7RTT5 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SSX7Q7RTT5 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSX7Q7RTT5 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSX7Q7RTT5 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSX7Q7RTT5 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SSX7Q7RTT5 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSX7Q7RTT5 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSX7Q7RTT5 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SSX7Q7RTT5 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SSX7Q7RTT5 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSX7Q7RTT5 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSX7Q7RTT5 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSX7Q7RTT5 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SSX7Q7RTT5 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SSX7Q7RTT5 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SSX7Q7RTT5 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SSX7Q7RTT5 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SSX7Q7RTT5 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SSX7Q7RTT5 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSX7Q7RTT5 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SSX7Q7RTT5 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSX7Q7RTT5 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSX7Q7RTT5 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SSX7Q7RTT5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SSX7Q7RTT5 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SSX7Q7RTT5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SSX7Q7RTT5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SSX7Q7RTT5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSX7Q7RTT5 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SSX7Q7RTT5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SSX7Q7RTT5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SSX7Q7RTT5 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SSX7Q7RTT5 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSX7Q7RTT5 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSX7Q7RTT5 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SSX7Q7RTT5 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SSX7Q7RTT5 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSX7Q7RTT5 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSX7Q7RTT5 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSX7Q7RTT5 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SSX7Q7RTT5 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms