Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV73

FGD6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD6Q6ZV73 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
FGD6Q6ZV73 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
FGD6Q6ZV73 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FGD6Q6ZV73 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FGD6Q6ZV73 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FGD6Q6ZV73 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FGD6Q6ZV73 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms