Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUT3

FRMD7, FERM domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD7Q6ZUT3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FRMD7Q6ZUT3 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms