Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMZ3

SYNE3, Nesprin-3, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE3Q6ZMZ3 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNE3Q6ZMZ3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNE3Q6ZMZ3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNE3Q6ZMZ3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms