Protein–RNA interactions for Protein: Q6XD76

ASCL4, Achaete-scute homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL4Q6XD76 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ASCL4Q6XD76 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms