Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXD4L3Q6VB84 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms