Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC171Q6TFL3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC171Q6TFL3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms