Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC42EP5Q6NZY7 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms