Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUI1

CCDC144NL, Putative coiled-coil domain-containing protein 144 N-terminal-like, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144NLQ6NUI1 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC144NLQ6NUI1 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms