Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NANOGP8Q6NSW7 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms