Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ19

CCSAP, Centriole, cilia and spindle-associated protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAPQ6IQ19 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCSAPQ6IQ19 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCSAPQ6IQ19 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCSAPQ6IQ19 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCSAPQ6IQ19 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCSAPQ6IQ19 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCSAPQ6IQ19 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCSAPQ6IQ19 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCSAPQ6IQ19 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCSAPQ6IQ19 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
CCSAPQ6IQ19 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCSAPQ6IQ19 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCSAPQ6IQ19 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCSAPQ6IQ19 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCSAPQ6IQ19 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCSAPQ6IQ19 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCSAPQ6IQ19 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCSAPQ6IQ19 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCSAPQ6IQ19 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCSAPQ6IQ19 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCSAPQ6IQ19 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCSAPQ6IQ19 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCSAPQ6IQ19 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CCSAPQ6IQ19 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCSAPQ6IQ19 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CCSAPQ6IQ19 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCSAPQ6IQ19 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CCSAPQ6IQ19 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCSAPQ6IQ19 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CCSAPQ6IQ19 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CCSAPQ6IQ19 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCSAPQ6IQ19 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CCSAPQ6IQ19 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCSAPQ6IQ19 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCSAPQ6IQ19 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CCSAPQ6IQ19 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCSAPQ6IQ19 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCSAPQ6IQ19 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCSAPQ6IQ19 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCSAPQ6IQ19 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCSAPQ6IQ19 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCSAPQ6IQ19 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCSAPQ6IQ19 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CCSAPQ6IQ19 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCSAPQ6IQ19 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCSAPQ6IQ19 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCSAPQ6IQ19 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CCSAPQ6IQ19 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCSAPQ6IQ19 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCSAPQ6IQ19 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCSAPQ6IQ19 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCSAPQ6IQ19 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CCSAPQ6IQ19 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCSAPQ6IQ19 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CCSAPQ6IQ19 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCSAPQ6IQ19 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCSAPQ6IQ19 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCSAPQ6IQ19 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCSAPQ6IQ19 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCSAPQ6IQ19 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCSAPQ6IQ19 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCSAPQ6IQ19 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCSAPQ6IQ19 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCSAPQ6IQ19 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCSAPQ6IQ19 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCSAPQ6IQ19 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCSAPQ6IQ19 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCSAPQ6IQ19 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCSAPQ6IQ19 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCSAPQ6IQ19 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCSAPQ6IQ19 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCSAPQ6IQ19 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCSAPQ6IQ19 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CCSAPQ6IQ19 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCSAPQ6IQ19 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CCSAPQ6IQ19 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCSAPQ6IQ19 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CCSAPQ6IQ19 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCSAPQ6IQ19 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCSAPQ6IQ19 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCSAPQ6IQ19 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms