Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CARMIL2Q6F5E8 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CARMIL2Q6F5E8 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms