Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ANKRD40Q6AI12 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ANKRD40Q6AI12 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms