Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CREB3L3Q68CJ9 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms