Protein–RNA interactions for Protein: Q63HK3

ZKSCAN2, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 2, humanhuman

Predictions only

Length 967 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN2Q63HK3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZKSCAN2Q63HK3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZKSCAN2Q63HK3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZKSCAN2Q63HK3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZKSCAN2Q63HK3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZKSCAN2Q63HK3 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZKSCAN2Q63HK3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms