Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TAF3Q5VWG9 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms