Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT5

MYOM3, Myomesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOM3Q5VTT5 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MYOM3Q5VTT5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
MYOM3Q5VTT5 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MYOM3Q5VTT5 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MYOM3Q5VTT5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MYOM3Q5VTT5 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MYOM3Q5VTT5 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms