Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HES3Q5TGS1 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HES3Q5TGS1 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HES3Q5TGS1 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HES3Q5TGS1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HES3Q5TGS1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HES3Q5TGS1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HES3Q5TGS1 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HES3Q5TGS1 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HES3Q5TGS1 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HES3Q5TGS1 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HES3Q5TGS1 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HES3Q5TGS1 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HES3Q5TGS1 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HES3Q5TGS1 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HES3Q5TGS1 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HES3Q5TGS1 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HES3Q5TGS1 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HES3Q5TGS1 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HES3Q5TGS1 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HES3Q5TGS1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HES3Q5TGS1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HES3Q5TGS1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HES3Q5TGS1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HES3Q5TGS1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HES3Q5TGS1 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HES3Q5TGS1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HES3Q5TGS1 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HES3Q5TGS1 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms