Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0F9

CC2D1B, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D1BQ5T0F9 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms