Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC158Q5M9N0 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms